同源重组修复缺陷(HRD)通常指细胞水平上的同源重组修复(HRR)功能障碍状态,可由HRR相关基因胚系突变、体细胞突变、及表观遗传失活等诸多因素导致。HRD的原因较为复杂,TCGA研究提示大约一半的高级别浆液性卵巢癌(HGSC)可能存在HRD,但仅有约20%的患者携带BRCA1/2致病性体系或胚系突变,BRCA1甲基化和其他HRR基因改变等亦可能造成HRD的结果[1]。
HRD会产生特定的、可量化的、稳定的基因组改变。杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因不平衡(TAI)、大片段迁移(LST)被视为常见的基因组瘢痕标志物,其未加权的总和作为基因组不稳定性评分(GIS)。以HRR基因的致病性变异状态加上GIS评分来评价HRD状态,较BRCA1/2基因检测,可以将HRD检测的获益人群扩大近一倍。
[1] Nature. 2011 Jun 29; 474(7353): 609-15.
HRD临床检测在PARP抑制剂治疗晚期卵巢癌疗效预测中具有重要的应用价值,可对卵巢癌患者进行分层,优化相应治疗决策,最大限度扩大PARP抑制剂临床获益人群;在乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌中,其对PARP抑制剂或含铂类药物的临床应用可能也具有潜在的指导价值[2]。
PARP抑制剂 | 批准机构 | 批准时间 | 适应症 | ||
Olaparib | FDA | 2020 | 奥拉帕利联合贝伐单抗用于一线卵巢癌,输卵管癌,原发性腹膜癌的维持治疗 | ||
FDA | 2020 | 转移性去势抵抗性的前列腺癌 | |||
Niraparib | FDA | 2019 | 复发性卵巢癌后线治疗 |
表1 FDA批准的HRD伴随诊断
除以上已批准的伴随诊断外,对于BRCA1/2突变检测阴性的患者,可进一步检测评估HRD的状态,从而扩大PARP抑制剂的获益人群。
[2] 同源重组修复缺陷临床检测与应用专家共识(2021版)
BRCA1 | BRCA2 | ATM | ATR | BARD1 | BRIP1 | PALB2 |
NBN | CHEK1 | CHEK2 | FANCL | RAD51C | RAD51D | FANCM |
FANCD2 | RAD51B | MRE11 | RAD50 | CDK12 | FANCA | BAP1 |
FANCC | BLM | FAM175A | FANCE | FANCF | FANCG | FANC1 |
RAD51 | RAD52 | RAD54B | RAD54L | RPA1 | XRCC2 | XRCC3 |
PTEN | PPP2R2A | MSH6 | EPCAM | MLH1 | MSH2 | PMS2 |
TP53 |
项目名称 | 核心技术 | 样本类型 |
人类同源重组修复缺陷(HRD)检测 | 探针杂交捕获 | FFPE/ 新鲜组织+外周血/唾液 |
检测HRR基因突变状态以及利用HRD评分对基因组不稳定性状态判读,相比单独检测BRCA1/2更能有效评估患者对PARP抑制剂敏感程度。
1、初诊/复发的晚期卵巢癌、输卵管癌、原发性腹膜癌患者;
2、HER2阴性局部晚期或转移性乳腺癌患者;
3、胰腺癌、前列腺癌等患者。
① 获益性好:共检测37个HHR相关基因、5个MMR相关基因,包括BRCA1/2突变状态;
② 采用中国人群特异杂合SNP位点结合三大基因组瘢痕标志物(LOH、TAI和LST)进行HRD评分,评估患者对PARP抑制剂敏感程度;
③ 同时检测体系/胚系变异结果,提示遗传风险,信息齐全,性价比高。
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